一、团队简介

　　大葱分子设计育种创新团队成立于2021年，是由4名青年教师组成的科研队伍，成员平均年龄34岁，其中2名成员具有生物信息学背景，2名成员具有分子生物学背景，生物信息学与分子生物学背景的完美结合，为团队开展功能基因组学研究和分子设计育种提供了坚实的技术基础。团队带头人为山东省泰山学者青年专家吕丙盛教授，长期从事植物生长发育的研究工作，近五年来以第一作者或共同第一作者在Molecular Plant、EMBO Journal、Trends in Plant Science、PLoS Genetics等高水平期刊上发表SCI论文十余篇，其中高被引论文2篇。先后主持国家自然科学基金面上项目及青年项目、中国博士后科学基金和山东省自然科学基金等11项。

　　二、主要成果介绍

　　近年来大葱种子进口额占比超过80%，国外品种的引入对我国大葱产业造成了巨大冲击，如何快速培育市场竞争力强的自主品种已成为大葱产业卡脖子问题。针对大葱产业重要科学问题，团队围绕产量、品质、抗逆、生育期、营养利用效率等重要农艺性状开展大葱功能基因组学及分子育种工作。对国产优质大葱品种‘章丘大梧桐’进行了测序与组装，首次完成了国产大葱品种参考基因组的绘制。目前已从33个国家搜集大葱种质资源719份，并已完成其中425份代表性种质资源的表型调查和全基因组重测序，获得了约27 Tb的数据。利用以上种质资源和组学数据，团队进一步整合葱属多个物种的基因组、转录组、变异组、表型组等数据，开发了葱属比较基因组学和功能基因组学数据库AlliumDB，为葱属作物遗传育种研究提供了重要的数据资源和分析平台，相关成果于2024年发表在Horticulture Research上。针对重要农艺性状构建了一系列高代自交系以及F2代遗传分离群体，通过GWAS和BSA-Seq联合分析，目前已完成大葱许多重要农艺性状调控基因的初定位。同时，建立了大葱成熟胚组培高频再生体系，为进一步构建大葱遗传转化体系奠定了基础。团队前期对全球425份代表性大葱种质进行了全基因重测序，挖掘出170多万个SNP位点，然后从中筛选了5000个位点，利用cGPS（Genotyping by Pinpoint Sequencing of captured targets）靶向测序分型技术，研发了大葱5 K液相育种芯片。该育种芯片可应用于大葱种质资源遗传多样性评估、品种真实性鉴定、遗传图谱构建、基因定位、全基因组关联分析、分子辅助定向改良和多基因聚合、智能育种等多个应用场景，为培育高产、优质、抗逆的优异大葱新品种提供高效基因型鉴定技术支撑。

　　作为一个蔬菜育种团队，我们在做好教学科研工作的同时，积极承担社会责任，努力将专业知识服务于社会实践，推动农业技术的普及与发展。近年来，多次赴乡村和农业基地进行技术培训和现场指导，帮助农户解决蔬菜种植中的实际问题，推动先进种植技术在农户中的应用，提升产量和质量，促进农民增收。同时积极推动校企合作，促进高校科研成果的产业化应用。通过与农业龙头企业的合作，将实验室的科研成果转化为实际生产力，近期已将我们研发的大葱液相芯片应用于大葱育种过程中，给大葱育种公司及机构提供技术支持。

　　团队合影

　　葱属功能基因组学综合信息平台（https://allium.qau.edu.cn/）